Son subditos de Paper Bowser y guardan la primera estrella Antella en su fortaleza la Fortaleza de los Hermanos Koopa.
Son 4 ninja koopas :Rojo,Amarillo,Verde y Negro.
Aparecen en Castillo Bowser pero son derrotados por Troopa Jr..
Tienen 5 pv cada uno y están liderados por ninjakoopa rojo al principio intentó engañar a mario con un robot bowser con 10 pv pero al ser destruido luchan y despues de perder caen en la prision que usaban para los bom-omb, junto con el robot destruido.